新生輔導課程安排中，率先登場的是，各處室主任與新生初相見的歡迎會！透過主任們對各項業務的介紹，無不表現出臺南慈濟高中齊心合一的正念與正向。學務處游棋竹主任即表示：「同學們先問自己三個問題：為什麼要來念慈濟學校？為什麼要學品德教育？為什麼生活教育很重要？」從最實際的層面，讓新生反問與省察教育最核心的價值，直截了當地揭示，好的品德也是一種能力與保證，瞬間擦亮臺南慈中最有特色的招牌。
學生進入中學的第一天，要適應的不只是學生，家長自然也是焦慮的，這股焦慮約莫來自於階段性改變的挑戰──對國一新生來說，小學與中學有著偌大的差異；而對高一新生來說，則要褪去褓姆式的管教，走向半獨立式的學習──除了學制迥異之外，也是兒童進入到青春期的階段，兩種挑戰，都不簡單！而南慈中導師們不辭辛勞，在還未見面就逐一電訪的用心，也都讓家長們得到一枚定心丸。
新生始業式中，學務處特意邀約輔導室與教務處，兩方聯手進行新生講座──前者針對新生內在的心理建設打穩地基，後者強調學制體制上應備的重點給予藍圖──家長和孩子直接感受到學校的專業和用心，也幫助同學在還未正式上課前，就穩定心態與腳步，對學校賦予最佳信任。
在國一新生講座「國中國小大不同」中，李柏毅組長和洪嘉穗組長，分別從教務與輔導兩個方向，對國一孩子們進行心理建設，此外輔導室也提供國一導師們性向量表，讓國一新生在自我探索上，進行初步評判。「慈中新生活：許一個希望的未來」，吳雅萍組長與陳柏伶組長則針對實務層面，為慈中高一新生建立觀念，尤其自己應盡與應得的權利與義務，要有具體的認識與規劃。不管是學習歷程的累積，還是志工服務的體驗，校方都讓同學們特別重視；無論是獎助學金、清寒補助等實際上的扶持，還是諮商輔導、心靈療癒等精神上的支援，校方也都毫無吝惜地給予。
而高一新生「選修課程介紹」單元中，教務處蕭國偉組長除了介紹高中必修課程的重點與修習要領，同時也邀約課程諮詢吳念祖老師，介紹校內自主學習、多元選修等各色課程規畫。無論是俄文、日文等第二外語的語言學習、電腦程式的實用設計、走讀府城的文化考察，或是尋訪山林的生態探索……豐富多元的課程，都讓高一新生們各個眼睛為之一亮，讓人充滿興奮與期待。
如果比喻人生是一步一腳印堆疊的旅程。進入中學，等同於離開爸媽攙扶，學習自己獨立，踏上成長的第一步──而新生始業輔導即是這第一步的準備動作──臺南慈中透過這準備動作，讓新生們感受到了校方強烈的鼓勵與期盼！校長、行政、導師等師長們的陪伴，讓孩子們面對未來，不用擔心自己會孤單面對，為自己的夢想且能更堅強邁進，同時深信選擇慈中是最正確的決定，未來三年，一定會有更趨成熟的進步，更豐富的學習成果。
